1.教学功能
为微生物学相关课程提供实践教学场所，学生可以在这里亲自动手操作，深入理解微生物的形态结构、生理生化特性、生长繁殖规律等理论知识，比如通过显微镜观察细菌、真菌等微生物的具体形态，增强对微生物微观世界的直观认知。
开展实验教学项目，培养学生微生物实验操作技能，像无菌操作技术、微生物的分离纯化、培养基的制备、微生物的染色和鉴定等基本技能，提高学生的动手能力和科学素养。
2.科研功能
进行微生物相关课题的研究工作，例如对新发现的微生物菌株进行筛选、鉴定，探究其代谢产物的功能及应用价值，或是研究微生物在特定环境下的生态分布及相互作用机制等。可进行微生物菌种的保藏，通过适宜的保藏方法维持菌种的活性和稳定性，为后续持续的科研工作提供实验材料。
3.检测功能
在食品、药品、环境等领域，可对样品中的微生物指标进行检测。比如检测食品中是否存在有害微生物（如大肠杆菌、沙门氏菌等致病菌）超标情况，检测药品生产环境的微生物污染程度，以及环境水样中微生物的种类和数量等，以保障相关产品质量和环境安全。
配置
1.显微镜：包括普通光学显微镜，用于观察微生物的细胞形态、大小等基本特征；有的还配备电子显微镜（如扫描电子显微镜、透射电子显微镜），能更清晰、更精细地观察微生物的超微结构，像细菌的细胞壁、芽孢等内部细微构造。
培养箱：常见的有恒温培养箱，能提供适宜的恒定温度环境（如细菌培养常用的37℃，真菌培养常用的 28℃左右），满足微生物生长繁殖需求；还有二氧化碳培养箱，适用于一些对二氧化碳浓度有要求的微生物培养，比如某些苛养菌的培养。
2.灭菌设备：例如高压蒸汽灭菌锅，利用高温高压蒸汽杀灭微生物，用于对培养基、玻璃器皿、接种工具等进行灭菌处理，保证实验的无菌环境；还有干热灭菌箱，适用于对耐高温但不宜湿热灭菌的物品（如玻璃吸管等）进行灭菌。
离心机：可以通过离心作用对含有微生物的样品进行分离，比如分离微生物细胞与培养液，便于后续的分析检测或进一步处理。
3.超净工作台：提供局部无菌操作环境，操作人员可以在其内部进行接种、转接微生物等操作，通过风机将空气过滤后吹入操作台面，防止外界杂菌污染。
接种工具：如接种环、接种针等，用于挑取微生物菌种，在不同培养基之间进行接种操作，保证菌种的转移和培养准确进行。
4.各种规格的玻璃器皿：包括培养皿、试管、三角瓶、移液管等，培养皿用于微生物的平板培养，试管常用来盛装培养基进行斜面培养等，三角瓶可用于大量培养基的配制、微生物的发酵培养等，移液管用于准确量取不同体积的液体试剂或微生物悬液等。
5.染色试剂：例如革兰氏染色试剂（结晶紫、碘液、乙醇、番红等），用于对细菌进行革兰氏染色，区分革兰氏阳性菌和革兰氏阴性菌；还有芽孢染色试剂、鞭毛染色试剂等，便于观察微生物的特殊结构。
生化鉴定试剂盒：包含各种用于检测微生物生化特性的试剂，通过微生物对不同糖类、蛋白质等底物的分解利用情况，来鉴定微生物的种类，比如常见的肠杆菌科细菌生化鉴定试剂盒。
6.微生物鉴定系统：一些较为先进的实训室配备全自动微生物鉴定系统，能快速、准确地对微生物进行鉴定，通过检测微生物的代谢指纹图谱等特征与数据库对比，给出鉴定结果。
